Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms