Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efhd1Q9D4J1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms