Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms