Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gpn3Q9D3W4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms