Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tspan11Q9D1D1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Tspan11Q9D1D1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms