Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hddc3Q9D114 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms