Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc47Q9D024 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms