Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snf8Q9CZ28 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms