Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mis12Q9CY25 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms