Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Cnih4Q9CX13 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Cnih4Q9CX13 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Cnih4Q9CX13 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Cnih4Q9CX13 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Cnih4Q9CX13 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Cnih4Q9CX13 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Cnih4Q9CX13 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Cnih4Q9CX13 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cnih4Q9CX13 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Cnih4Q9CX13 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cnih4Q9CX13 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnih4Q9CX13 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms