Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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