Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nicn1Q9CQM0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms