Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf3Q99P51 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms