Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cep41Q99NF3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms