Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brms1Q99N20 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms