Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdpd3Q99LY2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms