Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnpo2Q99LG2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnpo2Q99LG2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms