Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Gtpbp3Q923K4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp3Q923K4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp3Q923K4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp3Q923K4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp3Q923K4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp3Q923K4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp3Q923K4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp3Q923K4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp3Q923K4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp3Q923K4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp3Q923K4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Gtpbp3Q923K4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Gtpbp3Q923K4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp3Q923K4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp3Q923K4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Gtpbp3Q923K4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp3Q923K4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gtpbp3Q923K4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Gtpbp3Q923K4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gtpbp3Q923K4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gtpbp3Q923K4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gtpbp3Q923K4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gtpbp3Q923K4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gtpbp3Q923K4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Gtpbp3Q923K4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gtpbp3Q923K4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Gtpbp3Q923K4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Gtpbp3Q923K4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Gtpbp3Q923K4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Gtpbp3Q923K4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gtpbp3Q923K4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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Gtpbp3Q923K4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gtpbp3Q923K4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Gtpbp3Q923K4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Gtpbp3Q923K4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gtpbp3Q923K4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gtpbp3Q923K4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gtpbp3Q923K4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gtpbp3Q923K4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gtpbp3Q923K4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gtpbp3Q923K4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gtpbp3Q923K4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gtpbp3Q923K4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gtpbp3Q923K4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gtpbp3Q923K4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gtpbp3Q923K4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gtpbp3Q923K4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gtpbp3Q923K4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gtpbp3Q923K4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gtpbp3Q923K4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gtpbp3Q923K4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gtpbp3Q923K4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms