Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atl3Q91YH5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms