Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Setd3Q91WC0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms