Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csde1Q91W50 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csde1Q91W50 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms