Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx9Q91VH2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms