Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ4

Nle1, Notchless protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nle1Q8VEJ4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nle1Q8VEJ4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nle1Q8VEJ4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms