Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxc12Q8K5B8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms