Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolbQ8K409 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolbQ8K409 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms