Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Trim68Q8K243 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Trim68Q8K243 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim68Q8K243 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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