Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms