Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7I4

Apol9b, Apolipoprotein L 9b, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9bQ8C7I4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol9bQ8C7I4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms