Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Usp20Q8C6M1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp20Q8C6M1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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