Protein–RNA interactions for Protein: Q8C262

Irgc, Interferon-inducible GTPase 5, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IrgcQ8C262 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IrgcQ8C262 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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