Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTW9

Pak4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak4Q8BTW9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pak4Q8BTW9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pak4Q8BTW9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms