Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rd3Q8BRE0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms