Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms