Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pknox2Q8BG99 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pknox2Q8BG99 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms