Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ssxb10Q6XAR7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ssxb10Q6XAR7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ssxb10Q6XAR7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ssxb10Q6XAR7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssxb10Q6XAR7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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