Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cxcl3Q6W5C0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cxcl3Q6W5C0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cxcl3Q6W5C0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cxcl3Q6W5C0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cxcl3Q6W5C0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cxcl3Q6W5C0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cxcl3Q6W5C0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cxcl3Q6W5C0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cxcl3Q6W5C0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcl3Q6W5C0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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