Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc154Q6RUT8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc154Q6RUT8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms