Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms