Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl2Q6PA06 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl2Q6PA06 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms