Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec23ipQ6NZC7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23ipQ6NZC7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms