Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Top2bQ64511 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms