Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Zfp248Q640N4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Zfp248Q640N4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Zfp248Q640N4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Zfp248Q640N4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Zfp248Q640N4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Zfp248Q640N4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Zfp248Q640N4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Zfp248Q640N4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp248Q640N4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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