Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cd53Q61451 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cd53Q61451 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cd53Q61451 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cd53Q61451 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms