Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stxbp3Q60770 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms