Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tcf4Q60722 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tcf4Q60722 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms