Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd4Q60688 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms