Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms