Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Syne3Q4FZC9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syne3Q4FZC9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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