Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b4Q3V0X2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b4Q3V0X2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b4Q3V0X2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cldn34b4Q3V0X2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cldn34b4Q3V0X2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cldn34b4Q3V0X2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cldn34b4Q3V0X2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cldn34b4Q3V0X2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cldn34b4Q3V0X2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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