Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prdm6Q3UZD5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prdm6Q3UZD5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms